First insight into microbiome profile of fungivorous thrips Hoplothrips carpathicus (Insecta: Thysanoptera) at different developmental stages: molecular evidence of Wolbachia endosymbiosis

Agnieszka Kaczmarczyk , Halina Kucharczyk , Marek Kucharczyk , Przemysław Kapusta , Jerzy Sell , Sylwia Zielińska

Abstract

Insects’ exoskeleton, gut, hemocoel, and cells are colonized by various microorganisms that often play important roles in their host life. Moreover, insects are frequently infected by vertically transmitted symbionts that can manipulate their reproduction. The aims of this study were the characterization of bacterial communities of four developmental stages of the fungivorous species Hoplothrips carpathicus (Thysanoptera: Phlaeothripidae), verification of the presence of Wolbachia, in silico prediction of metabolic potentials of the microorganisms, and sequencing its mitochondrial COI barcode. Taxonomybased analysis indicated that the bacterial community of H. carpathicus contained 21 bacterial phyla. The most abundant phyla were Proteobacteria, Actinobacteria, Bacterioidetes and Firmicutes, and the most abundant classes were Alphaproteobacteria, Actinobacteria, Gammaproteobacteria and Betaproteobacteria, with different proportions in the total share. For pupa and imago (adult) the most abundant genus was Wolbachia, which comprised 69.95% and 56.11% of total bacterial population respectively. Moreover, similarity analysis of bacterial communities showed that changes in microbiome composition are congruent with the successive stages of H. carpathicus development. PICRUSt analysis predicted that each bacterial community should be rich in genes involved in membrane transport, amino acid metabolism, carbohydrate metabolism, replication and repair processes.
Autor Agnieszka Kaczmarczyk (WB / KGiB)
Agnieszka Kaczmarczyk
- Katedra Genetyki i Biosystematyki
, Halina Kucharczyk
Halina Kucharczyk
-
, Marek Kucharczyk
Marek Kucharczyk
-
, Przemysław Kapusta
Przemysław Kapusta
-
, Jerzy Sell (WB / KGiB)
Jerzy Sell
- Katedra Genetyki i Biosystematyki
, Sylwia Zielińska (WB / KGMB)
Sylwia Zielińska
- Katedra Genetyki Molekularnej Bakterii
Tytuł czasopisma/seriiScientific Reports, ISSN 2045-2322, (A 40 pkt)
Rok wydania2018
Tom8
Paginacja1-13
Objętość publikacji w arkuszach wydawniczych0.6
Klasyfikacja ASJC1000 Multidisciplinary
DOIDOI:10.1038/s41598-018-32747-x
URL https://www.nature.com/articles/s41598-018-32747-x
Języken angielski
LicencjaCzasopismo (tylko dla artykułów); opublikowana ostateczna; Uznanie Autorstwa (CC-BY); w dniu opublikowania
Punktacja (całkowita)40
Żródło punktacjijournalList
PunktacjaPunktacja MNiSW = 40.0, 28-10-2019, ArticleFromJournal
Wskaźniki publikacji Scopus SNIP (Source Normalised Impact per Paper): 2016 = 1.401; Impact Factor WoS: 2017 = 4.122 (2) - 2017=4.609 (5)
Liczba cytowań*
Cytuj
Udostępnij Udostępnij

Pobierz odnośnik do tego rekordu


* Podana liczba cytowań wynika z analizy informacji dostępnych w Internecie i jest zbliżona do wartości obliczanej przy pomocy systemu Publish or Perish.
Powrót
Potwierdzenie
Czy jesteś pewien?