Conformational preferences of proline derivatives incorporated into vasopressin analogues: NMR and molecular modelling studies

Emilia Sikorska , Dariusz Sobolewski , Anna Kwiatkowska


In this study, arginine vasopressin analogues modi- fied with proline deri vatives – indoline-2- carboxyl ic acid (Ica) , (2S,4R)-4 -(nap hthalen e-2-yl methyl) pyrrol i- dine-2-carboxylic acid (Nmp), (2S,4S)-4-aminopyro- glutamic acid (APy) and (2R,4S)-4-aminopyroglutamic acid, (Apy) – were examined using NMR spectroscopy and molecular modelling methods. The results have shown that Ica is involved in the formation of the cis peptid e bond . Moreove r, it reduces to a great extent the conformat ional flexibilit y of the peptid e. In turn, incorporation of (2S,4R)-Nmp stabilizes the backbone confor mat ion, whic h is heavily influe nced by the pyrrolidine ring. Howeve r, the aromatic part of the Nmp side chain exhibits a high degree of confor- mationa l freedom. With analogues IV and V , intro- ductio n of the 4-aminop yrogl umatic aci d reduces locally conformational space of the peptides, but it also results in weaker interactions with the dodecylphosphocholine ⁄ sodium dodecyl sulphate micelle. Admittedly, both analogues are adsorbed on the micelle’s surface but they do not penetrate into its co re. With analog ue V, the int eractio ns between thepeptideandthemicelleseemtobesoweakthat conformational equilibrium is established between different bound states.
Autor Emilia Sikorska (WCh / KChO / PBSB)
Emilia Sikorska
- Pracownia Badań Strukturalnych Biopolimerów
, Dariusz Sobolewski (WCh / KChO / PChP)
Dariusz Sobolewski
- Pracownia Chemii Peptydów
, Anna Kwiatkowska (WCh / KChO)
Anna Kwiatkowska
- Katedra Chemii Organicznej
Tytuł czasopisma/seriiChemical Biology & Drug Design, ISSN 1747-0277, (A 25 pkt)
Rok wydania2012
Objętość publikacji w arkuszach wydawniczych0.6
Słowa kluczowe w języku angielskimdodecylphosphocholine/sodium dodecyl sulphate mixed micelles, molecular modelling, NMR spectroscopy, proline derivatives, vasopressin
Klasyfikacja ASJC1313 Molecular Medicine; 1303 Biochemistry
Języken angielski
Punktacja (całkowita)25
Wskaźniki publikacji Scopus SNIP (Source Normalised Impact per Paper): 2014 = 0.9; Impact Factor WoS: 2012 = 2.469 (2) - 2012=2.409 (5)
Liczba cytowań*
Udostępnij Udostępnij

Pobierz odnośnik do tego rekordu

* Podana liczba cytowań wynika z analizy informacji dostępnych w Internecie i jest zbliżona do wartości obliczanej przy pomocy systemu Publish or Perish.