Characterization of conditions and determination of practical tips for mtDNA level estimation in various human cells

Paulina Jędrak , Natalia Sowa , Sylwia Barańska , Grzegorz Węgrzyn

Abstract

Determination of mtDNA copy number in the cell is crucial to understand many cellular processes. Recently, the number of studies with the use of mitochondrial DNA (mtDNA) content as the determinant of mitochondrial abnormalities increased greatly and is still growing, therefore, optimization of technical conditions for this analysis is crucial. Despite using similar laboratory protocols, some results cannot be compared between research centers, thus causing discrepancies in the assessment of mtDNA content. The aim of this work was to test which conditions of biological sample collection and storage affect estimation of mtDNA level relative to the nuclear DNA (nDNA) in the blood samples and dermal fibroblasts. We found that the time and temperature of sample storage, as well as the type of the blood sample (whole blood or leukocytes) influence the estimate of mtDNA/nDNA ratio in the blood. In the case of dermal fibroblasts collected from healthy control and Huntington disease patients, our data indicate that the passage number of cells is essential to obtain reliable results.
Autor Paulina Jędrak (WB / KBM)
Paulina Jędrak
- Katedra Biologii Molekularnej
, Natalia Sowa (WB)
Natalia Sowa
- Wydział Biologii
, Sylwia Barańska (WB / KBM)
Sylwia Barańska
- Katedra Biologii Molekularnej
, Grzegorz Węgrzyn (WB / KBM)
Grzegorz Węgrzyn
- Katedra Biologii Molekularnej
Tytuł czasopisma/seriiActa Biochimica Polonica, ISSN 0001-527X, e-ISSN 1734-154X, (A 15 pkt)
Rok wydania2017
Tom64
Nr4
Paginacja699-704
Objętość publikacji w arkuszach wydawniczych0.5
Słowa kluczowe w języku angielskimmtDNA level, leukocytes, fibroblasts, qPCR methodology, Huntington disease
Klasyfikacja ASJC1300 General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
DOIDOI:10.18388/abp.2017_2303
URL https://doi.org/10.18388/abp.2017_2303
Języken angielski
LicencjaCzasopismo (tylko dla artykułów); licence.documentVersion.FINAL_PUBLISHED; ; w dniu opublikowania
Punktacja (całkowita)15
PunktacjaPunktacja MNiSW = 15.0, 10-09-2019, ArticleFromJournal
Wskaźniki publikacji Cytowania Scopus = 3; Cytowania WoS = 2; Scopus SNIP (Source Normalised Impact per Paper): 2016 = 0.563; Impact Factor WoS: 2017 = 1.239 (2) - 2017=1.541 (5)
Liczba cytowań*5 (2019-09-15)
Cytuj
Udostępnij Udostępnij

Pobierz odnośnik do tego rekordu


* Podana liczba cytowań wynika z analizy informacji dostępnych w Internecie i jest zbliżona do wartości obliczanej przy pomocy systemu Publish or Perish.
Powrót